La fase piu importante della progettazione di un sito web e l'organizzazione delle informazioni.
prima di passare alla realizzazione del sito e delle pagine, e preferibile creare prospetti e suddividere le informazioni in sezioni e sottosezioni, e pensare alle interrelazioni tra le sezioni create.

Tutti i siti web sono organizzati attorno ad una home page che rappresenta il punto d'ingresso logico nel sistema di pagine web. L'home page inoltre, e la pagina piu visitata di ogni sito web e su questa pagina si basa la prima impressione dei vostri utenti. Se i vostri utenti avranno un'impressione negativa, difficilmente continueranno la navigazione delle vostre pagine web.

L'alta visibilita della home page la rende anche il posto migliore per inserire un menu di collegamenti o un sommario del sito. La maggior parte degli utenti visualizzera il sito su un monitor con dimensioni da 14 a 17 pollici, ed i 4/5 pollici verticali superiori sono l'unica parte sicuramente visibile sui loro schermi. Allora, per ottenere una navigazione efficiente, il numero di collegamenti nella parte superiore della home page deve essere massimo.

Ogni pagina di un sito web dovrebbe contenere: titolo, autore, affiliazione istituzionale, data di revisione, informazioni di copyright e collegamento alla home page.